ИНСТИТУТ ВОДНЫХ ПРОБЛЕМ И ГИДРОЭНЕРГЕТИКИ НАЦИОНАЛЬНОЙ АКАДЕМИИ НАУК КЫРГЫЗСКОЙ РЕСПУБЛИКИ образован в 1992 году.
Его деятельность ориентирована на проведение фундаментальных научных исследований и прикладных разработок, которые в Республике ранее не осуществлялись и имеют приоритетное значение для экономического развития Кыргызстана и Центрально-азиатских государств в области рационального использования водного и водно-энергетического потенциалов.
В Институте функционируют 6 лабораторий, Тянь-Шаньский высокогорный научный центр, в 2014 г. создан Ала-Арчинский полигон по изучению опасных гидрологических процессов.
Основными направлениями деятельности Института являются изучение региональных закономерностей формирования, режима, распределения, взаимосвязи поверхностных и подземных вод, оценка водных и гидроэнергетических ресурсов Иссык-Кульской и Чуйской областей и их динамика на фоне глобального изменения климата; разработка научных основ рационального использования, охраны водных и гидроэнергетических ресурсов; ценообразование в водопользовании; разработка оптимальных режимов работы комплексных водноэнергетических объектов; научная оценка комплексного использования и экологической безопасности водных ресурсов; создание систем информационного обеспечения для управления водными и земельными ресурсами; гляциология, биогеография, береговые процессы, экология высокогорья; мониторинг прорывоопасности высокогорных озер.
Институт сотрудничает со многими ВУЗами, организациями, промышленными предприятиями Кыргызской Республики и зарубежными организациями, такими как МЧС КР, Кыргызским государственным природным парком «Ала-Арча», Министерством сельского хозяйства и мелиорации КР, Министерством энергетики и промышленности КР, Министерством здравоохранения, Кумтор Оперейтинг Компани, Университетом Colorado (США), лабораторией LEGOS (Франция), Институтом метеорологии пустынь (Китай).
С 1995 годаИнститутом установлены научные связи с ведущими научными центрами США, Германии, Италии, КНР, Южной Кореи, Швейцарии и Швеции.
